吕骥很注重中国古典音乐的研究。他积极支撑北京古琴会的成立，倡导古琴打谱工作，推进《琴曲集成》的编纂出书，并写了《略论七弦琴音乐》的序言。1977年春夏，吕骥和黄翔鹏等4人构成古代音乐文物查询拜访小组，到河南、山西、陕西、甘肃4省调查先秦音乐文物，着重研究了陶埙与编钟，获得了对西周、春秋时代的编钟可以或许在一个钟上发出两个音的主要功效。这是过去典籍上没有记录过的中国劳动听民的严重缔造。中国对五声音阶始于何时，不断没有定论，通过此次对陶埙的查询拜访，获得了中国五声音阶构成于母系氏族社会后期的论证。他的《从原始社会到殷商的几种陶埙摸索中国五声音阶的构成年代》的论文，填补了中国音乐史研究中的一项空白。

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　　在抗日救亡歌咏活动期间，吕骥颁发了《新音乐的瞻望》、《伟大而贫弱的歌声》、《论国防音乐》、《音乐的国防带动》等文章。在这些文章中，他阐述了群众歌曲的社会意义以及对全国音乐活动的影响。他倡导“新现实主义”，否决“伤感主义”、“天然主义”，要求创作上既要有民族形式，又要有抗日救亡的思惟内容。1945年吕骥在延安还撰写了《中国民间音乐研究提纲》，对民间音乐的研究范畴和研究方式颁发了本人的看法。